Wilayah Kabupaten Paniai memiliki luas 18.104,63 Km² dengan ibukota di Enarotali dan terletak pada 13^o19' Bujur Timur dan 03^o56' Lintang Selatan.

Sejak akhir 2004 wilayah Kabupaten Paniai terbagi menjadi 21 ( Dua puluh satu ) wilayah distrik namun luas wilayah Kabupaten Paniai tidak mengalami perubahan yaitu seluas 18.104,63 Km² dari 21 distrik tersebut 9 ( sembilan ) distrik diantaranya adalah distrik pecahan sebelumnya dan ada 1 ( SATU ) Distrik baru yang merupakan gabungan dari beberapa distrik yang pecah. Jum lah desa di Kabupaten Paniai hanya bertambah 1 ( satu ) desa yang pecah menjadi 2 ( dua ) desa yaitu Desa Enarotali yaitu Desa Enarotali dan Awabutu.

Keadaan Topografi bergunung-gunung memiliki suhu udara yang rendah dan kelembaban udara relatif tinggi 18,7^o. Tercatat rata-rata kelembaban udara 72,3% pada tahun 2005.

Wilayah Distrik Homeyo dengan luas 3.529,48 Km² atau 19,50 % dari luas kabupaten merupakan Distrik terluas. Sedangkan Distik Kapiraya terluas, sedangkan 6,12 km² atau 0,09 % dari total luas kabupaten adalah Distrik dengan wilayah terkecil di Kabupaten Paniai.

• Sebelah Utara : Kabupaten Nabire
• Sebelah Selatan : Kabupaten Fak Fak
• Sebelah Timur : Kabupaten Puncak Jaya
• Sebelah Barat : Kabupaten Nabire