Sebagaimana lasimnya daerah lain di Propinsi Papua, Wilaya Kabupaten Paniai juga terdapat potensi bahan tambang seperti batu bara, emas, besi, batu kapur dan kualin. Penyebaran potensi bahan galian tambang di Kabupaten Paniai adalah sebagai berikut :

• Batu bara, endapannya ditemukan di Distrik Paniai Barat, Siriwo dan Distrik lainnya di Kabupaten Paniai.
• Emas, ditemukan di Distrik Sugapa,Agisipa, Homeyo,Aradide, Mbiandogo, Bogobaida, dan Paniai Barat.
• Besi, ditemukan di Puncak Cartens, jumblah cadangan besi diperkirakan sebesar 4 % dari tembaga dan perak.
• Batu kapur, ditemukan di Distrik Paniai Timur Dalam jutaan meter persegi.
• Pasir Kualin, terdapat di Distrik Paniai Barat.

Namun demikian pemanfatan sumber daya tersebut diatas masih sangat terbatas, kecuali bahan galian golongan C (Batu kapur dan Pasir Kualin) yang biasanya dimanfaatkan baik untuk pembangunan jalan dan jembatan, bangunan, maupun rumah-rumah penduduk. Untuk sumber daya lainnya masih dalam tahap eksplorasi.